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    对抗新冠:美国开放超算寻找药物及疗法

      [  中关村在线 原创  ]   作者:王征   |  责编:王征

    美国正在向全球的研究人员提供30台超级计算机的部分算力资源,以帮助寻找与冠状病毒有关的疗法和疫苗。超级计算机可以处理庞大的数据集,并且可以比其他硬件更快地对分子的行为进行复杂的模拟,因此希望这将有助于增强抗击病毒的能力。这些机器包括世界上最强大的超级计算机Summit,这些超级计算任务,由白宫科学技术政策办公室于2020年3月22日宣布成立的COVID-19高性能计算联盟成员拥有的超级计算机运行。

    对抗新冠:美国开放超算寻找药物及疗法
    超算寻找对抗冠状病毒的办法
    最初的组织的成员包括美国能源部的几个国家实验室,包括劳伦斯·利弗莫尔(Lawrence Livermore),桑迪亚(Sandia)和橡树岭(Oak Ridge),这是SUMMIT的所在地。该组织还包括麻省理工学院和伦斯勒理工学院,以及美国国家航空航天局和美国国家科学基金会。

    • Google Cloud,Amazon Web Services和Microsoft也是组织最初的一部分,它们将提供基于云的服务以加速研究工作。

    • 该联盟于4月6日宣布了几位新成员,包括芯片制造商AMD和nVIDIA,以及美国国家大气研究中心的怀俄明州超级计算中心。

    • 来自学术界,政府和企业界的研究人员可以通过网站将提案提交给超级计算组织。然后对高性能计算,生物学和其他领域的专家进行审查,并选择最有前途的负责这些任务执行。帮助建立了许多超级计算机的IBM正在协调该组织的工作。

    • 美国首席技术官迈克尔·克拉佐斯(Michael Kratsios)在声明中说:“美国正在团结起来,共同对抗COVID-19,这意味着释放我们世界一流的超级计算机的全部能力,以迅速推进治疗和疫苗的科学研究。”

      对抗新冠:美国开放超算寻找药物及疗法
      超算硬实力

    大数字:整个组织的算力超过402 petaflops。这就是现在可用的超级计算机的综合处理能力,这意味着它们每秒能够执行4.02亿亿次计算。仅Summit就能交付200 petaflops。30余台机器总共拥有350万个中央处理单元核心和41,000个图形处理单元,以帮助推动其工作。

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    超算才是硬实力

    背景:已经有迹象表明,超级计算机可以成为与COVID-19作战的重要工具。在有关新组织的博客文章中,IBM研究总监Dario Gil提到了Oak Ridge和田纳西大学的团队已经使用Summit进行的工作。他们用它筛选了8,000种化合物,并鉴定出77种有希望的化合物,它们可能与冠状病毒的“Summit”蛋白结合,从而阻碍了其感染宿主细胞的能力。组织在4月6日表示,已经将15项研究计划与财团的机器上可用的计算能力相匹配。

    计算也在以其他方式加紧应对。一些研究人员通过众包计算能力来试图更好地了解蛋白质的动力学,并且利用人工智能和其他方法来帮助应对这种病毒的研究人员已经获得了29,000份研究论文的数据集。IBM已经发起了一项全球编码挑战,其中包括对COVID-19的关注,亚马逊表示将投资2000万美元以帮助加速冠状病毒的测试。

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